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Analyse de la diversité génétique et phénotypique chez le rosier : quelques défis

Le : 19/06/2013 11h00
Par : Jérémy Clotault (IRHS - Université d'Angers)
Lieu : I 103
Lien web :
Résumé : La création variétale du rosier a connu un essor au XIXe siècle caractérisé par un large nombre de variétés obtenues et l’introduction de nouveaux caractères phénotypiques. La gestion de ces ressources génétiques dans un but de conservation et leur utilisation pour identifier le déterminisme génétique de caractères d’intérêt nécessite de caractériser leur diversité génétique et phénotypique. Les analyses génétiques sont d’autant plus difficiles que les ressources génétiques de rosiers que nous étudions sont composées d’individus de niveaux de ploïdie variables (diploïde à hexaploïde). Nous discuterons des conséquences sur les analyses génétiques à travers l’exemple du génotypage de marqueurs microsatellites (distinction entre bruit et allèle réel ; dosage du nombre de copies d’allèles) et de la reconstruction de pedigrees. Nous aborderons aussi la question de la définition de variables pertinentes pour décrire la variabilité de caractères phénotypiques complexes, par l’exemple de la remontée de floraison.