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Identification de patterns de marqueurs causaux génétiques par chaîne de Markov à sauts réversibles.

Le : 25/05/2010 10h00
Par : Christine Sinoquet (LINA - Université de Nantes)
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Résumé : Nous nous intéressons au problème de l'identification de marqueurs génétiques de prédisposition à une maladie génétique. Dans le cas des maladies génétiques complexes, ce n'est pas un marqueur génétique mais un ensemble de marqueurs génétiques qui prédispose à la maladie. Après un bref recensement des pistes déjà explorées, nous exposons notre contribution, qui relève de la modélisation bayésienne. Nous montrons comment il est possible de formaliser ce problème de sélection de variables (marqueurs génétiques) dans le cadre de la théorie des chaînes de Markov à sauts réversibles. Afin de diminuer la complexité du problème, notre objectif était d'intégrer connaissances génomiques et génétiques. Nous réussissons à tenir compte de cet objectif, dans le cadre théorique mentionné.